Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF335-201ENST00000322927 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 WDR47-204ENST00000369965 4240 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TP53-208ENST00000504290 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TP53-220ENST00000610623 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 IL17REL-201ENST00000341280 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 DPY19L2P2-205ENST00000439473 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 RPL13-201ENST00000311528 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 CSF3R-204ENST00000373104 2953 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 PLA2G6-203ENST00000402064 3011 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TSNAXIP1-201ENST00000388833 2429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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ANKRD39Q53RE8 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
ANKRD39Q53RE8 SRRM2-AS1-201ENST00000382313 3523 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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