Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DPP3-209ENST00000531863 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC117-205ENST00000448492 3937 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TMEM260-201ENST00000261556 4264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC5A9-210ENST00000533824 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FAM120C-202ENST00000375180 8057 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms