Protein–RNA interactions for Protein: Q495C1

RNF212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF212Q495C1 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ARPP21-213ENST00000428373 3150 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC26A6-204ENST00000383733 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC010969.2-201ENST00000602458 3231 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LINC00477-201ENST00000483544 1710 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SEC31A-205ENST00000395310 4259 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FAM212B-AS1-201ENST00000430373 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 POPDC2-208ENST00000493094 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 DYSF-208ENST00000410020 6657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
RNF212Q495C1 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms