Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TRIM71Q2Q1W2 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SIAE-206ENST00000618733 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM71Q2Q1W2 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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