Protein–RNA interactions for Protein: Q16875

PFKFB3, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB3Q16875 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PFKFB3Q16875 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms