Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
CLPPQ16740 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
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