Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CCDC6Q16204 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SLC4A7-214ENST00000455077 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KSR1-204ENST00000398988 7237 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC6Q16204 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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