Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 NALT1-202ENST00000450304 437 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
ITSN1Q15811 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GARS-210ENST00000627489 324 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SRP9-201ENST00000304786 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC026120.2-201ENST00000617239 309 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 TMEM14B-201ENST00000379530 787 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ITSN1Q15811 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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