Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTPRKQ15262 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTPRKQ15262 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PTPRKQ15262 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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