Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAM90A12P-201ENST00000519497 2375 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FAM90A24P-201ENST00000520792 2369 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CUL4BQ13620 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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