Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
FOXF2Q12947 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
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