Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 IL18BP-201ENST00000260049 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 USP44-202ENST00000393091 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 DNM1P46-202ENST00000415963 882 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMARCA4P51532 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF816-208ENST00000535506 529 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF235-203ENST00000589248 532 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL353658.2-201ENST00000629794 519 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 UCP2-202ENST00000536983 1413 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ANXA3-202ENST00000503570 1524 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC005009.2-201ENST00000452471 687 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AL031710.1-201ENST00000570022 468 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FCGR3A-208ENST00000638849 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMARCA4P51532 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms