Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DAP3P51398 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 306.7 ms