Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP8P40818 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP8P40818 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP8P40818 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
USP8P40818 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 BTBD9-206ENST00000481247 8525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
USP8P40818 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.8 ms