Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
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HOXC13P31276 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HOXC13P31276 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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