Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
FGFR3P22607 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms