Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FGFR4P22455 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms