Protein–RNA interactions for Protein: P19875

CXCL2, C-X-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2P19875 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 VAMP4-201ENST00000236192 5159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CTCFL-218ENST00000608440 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SNX1-201ENST00000261889 3373 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NOP2-212ENST00000541778 3038 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PARP10-203ENST00000524918 3469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 C15orf39-202ENST00000394987 4430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LMBR1L-201ENST00000267102 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC000120.1-201ENST00000414227 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MYO1D-206ENST00000579584 3500 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 TAPBP-234ENST00000434618 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092139.4-201ENST00000624318 2794 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
CXCL2P19875 MED24-204ENST00000394128 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms