Protein–RNA interactions for Protein: P19256

CD58, Lymphocyte function-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD58P19256 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CD58P19256 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CD58P19256 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CD58P19256 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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