Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
VAV1P15498 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VAV1P15498 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VAV1P15498 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms