Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KCNV1-201ENST00000297404 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCDC192P0DO97 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms