Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLTAP09496 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CLTAP09496 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms