Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 EDRF1-201ENST00000337623 4387 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTA1P02549 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTA1P02549 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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SPTA1P02549 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
SPTA1P02549 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
SPTA1P02549 IZUMO1R-201ENST00000328458 798 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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