Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SMAD6O43541 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SMAD6O43541 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SMAD6O43541 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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SMAD6O43541 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SMAD6O43541 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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