Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SCARB2-227ENST00000640957 3255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PASK-204ENST00000405260 4942 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
SMIM1B2RUZ4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms