Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6A4

CFAP20, Cilia- and flagella-associated protein 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP20Q9Y6A4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFAP20Q9Y6A4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFAP20Q9Y6A4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP20Q9Y6A4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms