Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
GTF3C3Q9Y5Q9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
GTF3C3Q9Y5Q9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms