Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
LRRC42Q9Y546 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LRRC42Q9Y546 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LRRC42Q9Y546 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms