Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAF6Q9Y4K3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAF6Q9Y4K3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms