Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FARP1Q9Y4F1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FARP1Q9Y4F1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FARP1Q9Y4F1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms