Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
R3HCC1Q9Y3T6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
R3HCC1Q9Y3T6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms