Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
UBE2J1Q9Y385 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
UBE2J1Q9Y385 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms