Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2P4

SLC27A6, Long-chain fatty acid transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A6Q9Y2P4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC27A6Q9Y2P4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A6Q9Y2P4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A6Q9Y2P4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms