Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HDAC5Q9UQL6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HDAC5Q9UQL6 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HDAC5Q9UQL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms