Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH4Q9UQ05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH4Q9UQ05 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms