Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MAPRE3Q9UPY8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MAPRE3Q9UPY8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms