Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGSF9BQ9UPX0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGSF9BQ9UPX0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGSF9BQ9UPX0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms