Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC8A2Q9UPR5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC8A2Q9UPR5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC8A2Q9UPR5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms