Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SNX6Q9UNH7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX6Q9UNH7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX6Q9UNH7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms