Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BARX2Q9UMQ3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BARX2Q9UMQ3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BARX2Q9UMQ3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 664.2 ms