Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MED23Q9ULK4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
MED23Q9ULK4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MED23Q9ULK4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms