Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY7

CDV3, Protein CDV3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDV3Q9UKY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDV3Q9UKY7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDV3Q9UKY7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms