Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CHIC2Q9UKJ5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CHIC2Q9UKJ5 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CHIC2Q9UKJ5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms