Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MRTO4Q9UKD2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MRTO4Q9UKD2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MRTO4Q9UKD2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms