Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD1Q9UIS9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MBD1Q9UIS9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MBD1Q9UIS9 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms