Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTNNA3Q9UI47 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNNA3Q9UI47 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNNA3Q9UI47 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms