Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SRP68Q9UHB9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SRP68Q9UHB9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRP68Q9UHB9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms