Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOBEC3BQ9UH17 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOBEC3BQ9UH17 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms