Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGC7

MTRF1L, Peptide chain release factor 1-like, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1LQ9UGC7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1LQ9UGC7 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1LQ9UGC7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms