Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ORC3Q9UBD5 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ORC3Q9UBD5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ORC3Q9UBD5 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms